Thursday, January 6, 2022

Bigtable paper notes taken in Chinese | My study notes

Jan. 6, 2022

Here is the article. 

Paper: Google Bigtable paper

Notes author: Lhfcws Wu
Time: 2013-07-24

Preface:
仅为个人阅读心得,按照原论文Section顺序写的笔记。
原论文Sections: (本笔记主要关于粗体的章节,即原理部分)
1 Introduction
2 数据模型(行,列族,时间戳)
3 API支持简述
4 Bigtable构建(文件格式SSTable,所依赖的一些框架服务)
5 Bigtable的基础实现(Tablet定位,分配,服务和memtable压缩)
6 优化措施
7 性能评估
8 Google实际应用
9 经验教训
10 相关工作

Data Model (数据模型)

行键: 任意小于64KB的字符串。
Bigtable内部的行键会按照字典序排列,对于任何单个的行键操作都是原子性的。

Tablet: 有的翻译为片,是Bigtable分配和负载均衡的单元单位,动态管理。(此概念在原理部分尤为重要)

列族: 一定数量的列的集合,是访问控制的单元单位。
一般同一列族内的列都是同种类型,一个table里的列族数量一般期望是尽量少,最多不超过几百个,但一个table里可以有很多的列。

列键: 一般从属于某个列族,命名语法如 family:qualifier

时间戳: 一个64位整数,每一行不同的时间戳对应不同的行版本。时间戳一般由客户端自动生成,也可以由用户编程中指定数字。

版本:
Bigtable引入了版本管理(semi),由于每一个时间点行操作是原子的,所以默认由时间戳代表该行的不同的版本。但我称Bigtable的版本管
理是semi-version-control,因为实际上,由于性能和容量的原因决定了它不像svn或git那样会保存之前所有修改的状态。一般可以由
用户选择要保留最近的n个版本。其余的会被Bigtable的GC机制回收掉。

API

Bigtable支持多样的甚至较复杂的操作,支持单行事务,支持与Map-Reduce一同使用。

Bigtable构建

Bigtable借助分布式GFS(Google FileSystem)来存储日志和数据。其内部存储文件格式为SSTable。

SSTable:
提供一个持久有序不可变的map。每个SSTable会占一段连续的块序列(一般每个块大小为64KB,可配置修改),起始的块索引会存在SSTable 的末端,块索引可用于直接定位SSTable在磁盘上的位置(因此块索引会在SSTable打开之前读入内存)。有时,SSTable可完全先映射到内存中,减少操作时的磁盘开销。
-> SSTable - 分布式存储

Chubby:
-> Chubby详细介绍

(下面的笔记是结合原paper关于Chubby部分和上面链接博客的核心思想提炼)


Chubby是一个高可靠用于分布式的锁服务,目的是为了解决分布式一致性问题。总体基本上分为了两部分:服务器一端,称为Chubby cell;客户端一端,每个Chubby的client都有一个Chubby library,这两部分通过RPC进行通信。

Chubby
cell是一个分布式的系统,一般包含了5台机器,整个文件系统是部署在这5台机器上的。cell中每台server一般称为replica(副本)。
Chubby工作时会从这些replicas中选举出一个master,每个master具有一个master lease,在此期间不会再有选举。
master负责和client的通信,接收client的读写请求;而其他replicas不和client通信,只和master通信。
replicas(包括master)会维护同一个DB的拷贝。一旦master收到写请求,master会把改写请求转发给其他replicas,然后更新自己的DB copy,同时其他replicas收到请求也会更新自己所维护的DB copy。读操作自然只需要从master获取即可。这样一旦master宕机,其他replicas也能迅速地选举出新的master。

对内五台服务器,Chubby使用Paxos算法来保证内部分布式一致性,对外的一致性保证就是它的lock service。(Paxos算法

client端通过Chubby library的接口调用,在Chubby cell上创建文件来获得相应的锁的功能。client会维护一个Chubby服务的session,session同样也会有session lease。client可以通过注册回调函数来通知Chubby cell发生了变化或过期事件。

Chubby的 lock service 实现实际上是一个分布式的文件系统,所谓的锁就是文件。Chubby会在一个特定的目录下进行锁文件的查找、创建和删除。

Bigtable的基础实现

Bigtable核心组件主要有三部分:
1. 一个与每个客户端相连接的Library
2. 一个master服务器(此master和Chubby cell master无关)
3. 多个tablet服务器

master服务器负责tablets的分配回收,管理tablet服务器的lease,tablet servers的负载均衡,GFS的文件垃圾回收以及处理表和列族增删导致的schema变化。

每一个tablet服务器管理几十到上千的tablets,负责处理本服务器内的tablets的读写请求和tablets的合并分裂。客户端与tablet服务器的读写通信不需要经过master,也不依靠master进行tablet定位。

一个Bigtable集群会拥有几百个以上的Tables,每个Table对应一个或多个Tablets。初始一个Table对应一个Tablet,当Table膨胀的时候,其对应的Tablet也会膨胀。当Tablet达到一定size大小的时候会分裂成多个tablets(一般默认每个100M~200M)。

Tablet Location

Tablet存储的三层B+树架构:



第一层为Root Tablet(1st METADATA Tablet),拥有所有METADATA Tablets的locations。Root Tablet永不分裂,即METADATA Tablets的数目会有上限。
第二层为METADATA Tablets,每个METADATA Tablet大约占1KB内存,定位一个UserTable,并记录tablet操作的log。
第三层即为UserTable。

原paper中有个例子: 假设META Tablet上限为128MB,那么他一共能映射的用户级的Tablets为(2 ** 17) * (2 ** 17) = 2 ** 34 个, 折算成字节则为 (2 ** 34) * 128MB = 2 ** 61 .

客户端会缓存它请求过的tablet locations。如果cache miss,客户端会按照三层架构去递归地查询所要的tablet location。

  1. 如果客户端缓存为空,定位算法会耗时3个RTT。
  2. 如果客户端缓存过时,定位算法会耗时6个RTT。
  3. Prefetch优化:当客户端请求到一个METADATA Table的时候,它会额外读取部分并非本次请求的metadata,以便不时之需。

Tablet Assignment

当tablet被某Tablet Server管理的时候,Chubby会生成一个相应的锁文件。
Tablet Server会遇到以下几种情况:
1. 锁文件不存在:Tablet自己kill掉自己
2. 丢失Chubby Session或其他失去锁的情况: 停止伺服相应的tablet

Tablet会遇到以下情况:
1. 被Tablet Server伺服,此时为assigned状态
2. 被master Server管理,处于unassigned状态
3. 刚被Tablet Server丢失,还未被master回收。此时若master发现此tablet,会先询问其他Tablet Servers对此tablet的锁状态,否则将其回收至unassigned。

Master Server:
1. Tablet Server出问题,Master会尝试去获得其锁文件,一旦获得成功就会kill掉此台出问题的Tablet Server。
2. Chubby session过期,Master会kill掉自己。但并不会改变Tablet Servers的相应tablets的分配状态。

(以上主要是通过描述Tablet 的容错性来展现tablet assignment的一些细节,具体建议看原文 5.2 部分)

Master startup steps:
1. Master获取Chubby中唯一的Master lock,以证明其Master身份。
2. Master扫描alive server。
3. Master与每台alive server通信,以确定当前 tablet 的分配情况。
4. Master扫描METADATA Table来获取全部的 tablets 目录,根据step 3的结果将每个tablet 分为 assigned 和 unassigned,unassigned的加入到一个 Unassigned Set 中。

Tablet只受Table的变化而变化(膨胀,分裂,合并等),Tablet Server直接管理tablet的变化,然后再通过修改METADATA(即commit步骤),将变化信息notify给Master。

Tablet Serving

Tablet的持久化是通过GFS的文件形式实现的。
METADATA实际包括一堆SSTable(Tablet,a set of redo points)

Memtable:内存中一段buffer,有序存储最近(具体多近看用户配置)提交的内容。


写操作请求到达Tablet Server:
1. 检查格式完备性和权限
2. 将写操作写到commit log中。
3. 提交的内容同时写到memtable中。

读操作请求到达Tablet Server:
1. 检查格式完备性和权限
2. 将SSTable和Memtable里的内容合并排序
3. 根据字典序直接查找定位,返回结果。

Compaction

minor compaction:如果写操作时,memtable大小达到一定阀值,则在内存中创建一个新的memtable,旧的memtable转化成SSTable写到GFS中。

merging compaction:读取部分SSTables和Memtable,将其合并生成新的SSTable,然后丢弃输入部分的SSTables和Memtable。此操作会周期性地在后台进行,目的是应对minor compaction过程持续地生成新的SSTable。

major compaction:如果执行merging compaction时是将所有的SSTables合并,则此过程称为major compaction。Bigtable也会定期执行major compaction,目的是为了清除minor  compaction过程可能产生的一些已删除条目。

My study notes

  1. Jan. 6, 2021, I will use it to help me understand English version of bigtable notes from washington.edu. Here is the blog. 



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